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lncRNA Transcriptomics Analysis

lncRNA转录组分析解决方案

LncRNA简介


长链非编码RNA(long coding RNA,lncRNA)是一类转录本水平超过200nt、不编码蛋白的RNA。LncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,不具备生物学功能。然而,近几年的研究表明lncRNA能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因表达、参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有密切联系。现阶段,利用高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,有助于科研工作者更快发现那些具有重要调控功能的lncRNA,分析其与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息,且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制,还可对新的lncRNA进行预测及功能分析,极大促进lncRNA的深入研究


服务内容


测序原始数据预处理,序列拼接比对,lncRNA筛选及注释:已知lncRNA注释和新lncRNA预测,lncRNA定量及差异表达分析,差异表达lncRNA靶基因预测,差异表达lncRNA 结构变化分析,差异lncRNA靶基因的GO生物学过程,细胞组分,分子功能等富集分析和KEGG信号通路分析,lncRNA基因表达时序分析(Gene Expression Trend Analysis),lncRNA-mRNA和lncRNA-miRNA共表达网络分析(Co expression Network),差异表达lncRNA靶基因KEGG通路富集分析(lncRNA Target Pathway Network)和ceRNA 网络分析等。


整体解决方案和部分结果展示