Small RNA简介

小RNA是指在生物体中表达的，不编码蛋白，长度较短（1 8~30nt或40nt）的RNA分子，参与诱导基因沉默，参与细胞生长、发育、基因转录和翻译等诸多生命活动的调控过程。其中miRNA，是目前功能研究较为透彻的一类小RNA(20~25nt)。 miRNA通过与特定mRNA的结合调节相应基因的表达，这些基因称为该mRNA的靶基因。现阶段，利用高通量测序技术进行miRNA测序，并结合生物信息学的预测工具进行miRNA分析，有助于科研工作者更快发现那些具有重要调控功能的miRNA，分析其与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取miRNA序列以及位置信息，且突破了常规miRNA芯片检测技术的使用范围限制，还可对新的miRNA进行预测及功能分析，极大促进miRNA的深入研究。

服务内容

测序原始数据的处理和质量质控，1 8~30 nt Small RNA 的长度分布分析；样品间的公共序列和特异序列的分析；Small RNA碱基偏好性分析；Small RNA 在选定的参考基因组上的分布（只能选定一个参考基因组）；Small RNA 与rRNA、 tRNA、 snRNA、 snoRNA的比对信息；Small RNA 与重复序列的比对信息（需提供选定参考基因组对应的重复序列注释信息；Small RNA 与 exon/intron 的比对信息(需提供选定参考基因组对应的基因注释信息)；Small RNA 与 miRBase 中指定范围的已知的 miRNA 的比对；按照优先级将 small RNA 进行分类注释；对未注释的small RNA进行预测，并绘制新miRNA的二级结构图；对已知miRNA 的表达量统计和家族分析（需要提供参考物种拉丁文名称）；样品间miRNA差异分析（2个或2个以上样品） 和聚类分析（3个或3个以上样品）；miRNA靶基因预测（需要提供基因编码序列， 可选择多做预测算法）;miRNA靶基因GO注释富集分析和KEGG信号通路富集分析；miRNA的碱基编辑分析（已知miRNA）；差异miRNA靶基因预测;差异miRNA靶基因GO注释富集分析和KEGG信号通路富集分析等。

整体解决方案和部分结果展示