mRNA简介

转录组（transcriptome）研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。转录组狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者，蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述，转录组成为研究基因表达的主要手段，转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带，转录水平的调控是目前研究最多的，也是生物体最重要的调控方式。mRNA测序直接对特定样品在某一状态下产生的全部mRNA进行高通量测序，在获得基因表达信息的同时，还能够推测mRNA结构、识别可变剪切位点以及cSNP（编码序列单核苷酸多态性）、解析RNA编辑等，从而获取更全面的转录组信息。

服务内容

原始转录组数据的预处理和质量控制。对于同一样品：可进行新转录本发现和功能预测以及结构预测；基因表达水平研究；转录本结构研究（包括UTRs区域鉴定，Start codon鉴定，内含子边界鉴定和可变剪切研究）；转录本结构变异研究（包括融合基因鉴定和cSNP研究）；非编码区域功能研究（包括鉴定ncRNA和miRNA前体及成熟miRNA预测）；对于不同样品：可进行基因表达水平研究；基因表达差异分析和筛选；差异基因GO和KEGG功能注释富集和聚类分析（包括差异基因聚类分析，差异基因GO富集分析，差异基因KEGG富集分析和差异基因蛋白互作分析）以及新转录本发现和功能预测以及结构预测。

整体解决方案和部分结果展示